El exarquero de River, que fue campeón en el Clausura 2008, fue contratado por el Deportivo Cuenca y ya tuvo su debut en un partido amistoso, donde fue ovacionado por los hinchas del equipo "Morlaco".
Muchos le perdieron pisada después de su salida de River a fines de 2010. Atrás quedó la disputa con Daniel Vega para tener la titularidad en el arco del Millonario, y así también los problemas de salud que le impidieron pasar al Atlas mexicano a mediados de 2009. Pero Juan Marcelo Ojeda sigue atajando en el fútbol latinoamericano y ya fue presentado en Deportivo Cuenca.
Sin embargo, Cuenca es el segundo equipo del "Chelo" post-River. Tras alejarse del equipo que por entonces dirigía Juan José López, Ojeda pasó al fútbol venezolano, donde atajó para Deportivo Anzoátegui durante todo el 2011.
Ya en el 2012, fue presentado en la llamada "Noche Colorada", donde el equipo presenta a sus refuerzos (entre los que está otro ex River, Miguel Paniagua), el "Chelo" debutó con la camiseta "Morlaca" y se llevó una ovación por parte de los hinchas, que tienen muchas expectativas en cuanto al exarquero Millonario.
“Busco continuidad, mejorar el nivel y trabajar duro para ponerme lo más pronto posible en la forma física ideal”, afirmó quien integrara el último plantel de River en consagrarse campeón hasta el momento. Ojalá se le dé.